药理作用
灸疗用药也比较丰富，除了单用艾绒的清艾条，还有添加了各种药物的药艾条。艾条所用的药物中，艾是必不可少的，离开了艾，艾灸就不存在了。
灸疗中使用的药物大多数为辛香之品，含有的挥发油成分和辛辣素能够对表皮细胞产生，增加的通透性，便于吸物，从而使药物的药效能得到充分的发挥利用。同时皮肤腺体在表皮的开口因辛辣、温热而扩大，一些大分子和脂溶性的药物可通过腺体开口而进入体内，有利于这些药物药效的发挥。

局部作用
艾灸对人体局部的温热，能增强局部血液循环和淋巴循环，皮肤组织的代谢能力也会得到加强，炎症、粘连、渗出物、血肿等病理产物同时能得到很好的消散。局部温热还可以引起大脑皮质抑制性物质的扩散，降低神经系统的兴奋性，从而达到、止痛的作用，而且没有任何的毒。温热还能促进药物的吸收，将艾绒本身的药效、艾条中其他添加药材以及间隔物的药效充分发挥出来。另一方面，艾灸还具有近红外辐射作用。艾灸的近红外辐射为机体的活动提供了必要的能量，而且艾灸所发出的近红外光所提供的能量可以被人体所调控。在灸疗过程中，近红外线辐射具有很强的穿透力，能使能量通过经络传导至远端直至病所，还能通过穴位激起人体自身的机体免疫力，使人体自身正常的生理机能得到恢复。

艾条灸
艾条灸又称艾卷灸，是将艾条点燃后在施灸部位（穴位）进行熏灸的方法。艾条灸分为手持灸和艾灸器灸两种方法。手持灸又分为温和灸、回旋灸和雀啄灸三种。
（1）温和灸：施灸者左手中、食二指放于被灸穴位两侧，以感知患者皮肤受热程度；此法温通经脉、散寒祛邪，多用于灸治慢，临床运用为广泛。
（2）回旋灸：将点燃的艾条，旋于施灸部位上，距离皮肤3cm，平行往复左右移动或反复旋转，使皮肤有温热感而不至于灼痛；一般可灸20-30分钟；适用于风湿痹证、神经性麻痹及广泛性皮肤病等。
（3）雀啄灸：艾条燃着的一端对准穴位，上下移动，鸟雀啄米样施灸，一般可灸5分钟左右。多用于灸治急、昏厥急救、儿童疾患等；此法热力较强，注意避免皮肤。

升阳举陷，恢复机体的正常功能
阳气虚弱不固可致上虚下实，气虚下陷，出现脱肛、阴挺、崩漏、久泄久痢、滑胎等症，《灵枢·经脉》说“陷下则灸之”，因此气虚下陷，脏器下垂等症可用艾灸疗法。脾胃学说创始人李东垣认为“陷下者，皮毛不任风寒”“天地间无他，惟阴阳二者而已，阳在外在上，阴在内在下，今言下陷者，阳气陷入阴气之中，是阴反居其上而复其阳，脉证俱见在外者，则灸之”。因此，艾灸不仅可以温阳，升阳举陷，安胎固经，还可治疗卫阳不固、腠理疏松等症，如脱肛、阴挺、久泄等病。